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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点：可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

福建龙文对台交流“一文一武”两展馆开馆******

　　中新网漳州2月3日电 (廖珍妹)“我生长在台湾，从小到大接触到的无不是中华传统文化。”3日上午，参观完在福建省漳州市龙文区举办的“漳州市‘科举制度在台湾——台湾进士专题展’县区巡展第一站龙文站”和“龙文武术‘迁台记忆’物品归集展”两个对台交流展览后，台胞蒋彩琳表示，她更加深刻地感受到两岸一家亲、同根同源。

“漳州市‘科举制度在台湾——台湾进士专题展’县区巡展第一站龙文站”活动现场。　廖珍妹摄

　　蒋彩琳介绍，她“登陆”多年，近几年来到漳州，目前在陆家嘴国泰人寿漳州营销服务部担任顾问。蒋彩琳表示，“一文一武”两个展览内容丰富、生动形象，她和观展的台胞们更加了解两岸文化传承融合情况，有利于两岸同胞共同弘扬中华传统文化。

“龙文武术‘迁台记忆’物品归集展”活动现场。　廖珍妹摄

　　据悉，此次活动由漳州市文旅局、漳州市台联、龙文区委台港澳办、龙文区台联主办。通过“一文一武”两个活动，展现两岸文化同根同源，促进两岸文化融合。其中，“科举制度在台湾——台湾进士专题展”，展示科举制度在台湾的设立和发展等，通过史料和图片再现“台湾进士”这一群体的风采和成就。“龙文武术‘迁台记忆’物品归集展”，则展示了从“迁台记忆”征集活动中征集而来的近百件两岸武术交流相关物品。

　　“清朝时期台湾共产生了33位文进士。”漳州市台联会长、台盟漳州市委会主委方丽云在“‘科举制度在台湾——台湾进士专题展’县区巡展第一站龙文站”开馆仪式上致辞时介绍，漳州是台湾主流文化的主要影响源，漳州人是中华文化进入台湾的主要传播者。据不完全统计，台湾进士中不少有在漳州求学和参加科举考试的经历，在漳州府学注册考取文举人的台湾学子有20人。